漢字で書かないほうが良い言葉、どちらでもいい言葉、漢字で書くべき言葉があります。漢字に変換できるものは全て漢字で書く！という人はさすがに少ないですが、それでも、ひらがなで書くべきところを漢字で書く人は一定数います。

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公文書における作文のルール

これまで公用文の作成の要領は昭和２７年の内閣官房長官依命通知別冊がありました。これをもとに公文書のルールが定められており、たとえば横書きでは読点に「,」（コンマ）を使うルールがあったりします。また、平成22年11⽉30⽇の内閣訓令第1号「公⽤⽂における漢字使⽤等について」では、漢字とかなの使用ルールがまとめられています。

しかし、これらが時代遅れになったため、令和3年3月12日に文化審議会国語分科会から「新しい「公用文作成の要領」に向けて（報告）」が報告され、令和4年1月7日には「公用文作成の考え方」が出されました。

「公用文作成の考え方」の内容

基本的には、ここに書かれている原則に沿って書けば問題ありません。数は多いですが、読みやすくまとまっています。

常用漢字表の字種・音訓で書き表せない場合

訓による語はひらがなで書く

敢えて　→　あえて
予め　→　あらかじめ
或いは　→　あるいは
未だ　→　いまだ
謳う　→　うたう
嬉しい　→　うれしい
概ね　→　おおむね

自ずから　→　おのずから
叶う　→　かなう
叩く　→　たたく
止める/留める　→　とどめる
経つ　→　たつ
為す　→　なす
則る　→　のっとる

捗る　→　はかどる
以て　→　もって
依る/拠る　→　よる
宜しく　→　よろしく
坩堝　→　るつぼ

他にも、３日間に亘り（→わたり）歌い続けた
「渡り」と書く誤用が非常に多く、ひらがなで書く方が良いでしょう。

音による語でも、漢字を用いないで意味の通るものは、そのまま平仮名で書く

斡旋　→　あっせん
億劫　→　おっくう
痙攣　→　けいれん
御馳走　→　ごちそう

颯爽　→　さっそう
杜撰　→　ずさん
石鹸　→　せっけん
覿面　→　てきめん

咄嗟　→　とっさ
煉瓦　→　れんが

難しい漢字を書くとなんだかすごそう！と思う方はこういった漢字を使いがちです。

常用漢字表にない漢字だけをかな書きにする、または、括弧内に読み方を示す

改竄　→　改ざん、改竄（かいざん）
絆　→ 　きずな
牽引　→　けん引、牽引（けんいん）
口腔　→　口こう、こうくう
招聘　→　招へい

綴る　→　綴る、つづる
綴じる　→　とじる
酉の市　→　酉（とり）の市、とりの市

注：化学用語など、片仮名を用いる場合もある。
燐酸　→　リン酸
沃素　→　ヨウ素
弗素　→　フッ素
蛋白質　→　タンパク質

結構な割合でタンパク質を「タンパク」と省略して書く方がいますが、口語表現なのでよくありません。

常用漢字表に使える漢字があっても仮名で書く場合

助詞

位　→　くらい（「くらい」は口語っぽいので、「程度」と書き換え可能）
等　→　など
程　→　ほど（「程度」と書き換え可能）

助動詞

～の様な　→　～のような
しょうが無い　→　しょうがない

動詞・形容詞などの補助的な用法

～して行く　→　～していく
～して頂く　→　～していただく
～して下さる　→　～してくださる
～して来る　→　～してくる

～して見る　→　～してみる
～して欲しい　→　～してほしい
～して良い　→　～してよい
～して貰う　→　～してもらう
実際の動作･状態等を表す場合は「…街へ行く」「…賞状を頂く」「…贈物を下さる」「…東から来る」「しっかり見る」「資格が欲しい」「声が良い」のように漢字を用いる。

形式名詞

事　→　こと
時　→　とき
「事は重大である」「法律の定める年齢に達した時」「家を建てる所」「所持する物」
「裁判所の指名した者」のように、具体的に特定できる対象がある場合には漢字で書く。
所・処　→　ところ
物・者　→　もの
中・内　→　うち（「…のうち」等。「内に秘める」などは漢字で書く。）
為　→　ため
通り　→　とおり（「通知のとおり…」「思ったとおり」等。「大通り」などは漢字で書く。）
故　→　ゆえ（「それゆえ…」等。「故あって」などは漢字で書く。） 様→よう（「このような…」等）
訳　→　わけ（「そうするわけにはいかない」等。「訳あって」などは漢字で書く。）
指示代名詞
これ それ どれ ここ そこ どこ
漢字の持つ実質的な意味が薄くなっているもの
有難う　→　ありがとう（ただし「有り難い」は漢字で書く。）
お早う　→　おはよう
今日は　→　こんにちは
逆様　→　逆さま
いわゆる当て字や熟字訓（常用漢字表の付表にある語を除く。）

何時　→　いつ
如何　→　いかん
思惑　→　思わく

流石　→　さすが
素晴らしい　→　すばらしい
煙草　→　たばこ

一寸　→　ちょっと
普段　→　ふだん
滅多　→　めった
その他
共→とも（「…するとともに」等。ただし「彼と共に…」などは漢字で書く。）
仮名書きを基本とするが一部のものは漢字で書く
接続詞
更に　→　さらに（副詞の「更に」「更なる」は漢字で書く。）
然し、然しながら　→　しかし、しかしながら
従って　→　したがって（動詞の「従う」は漢字で書く。）
然して　→　そして、そうして（「しかして（而して）」と読むべきところだが）
其処で　→　そこで
其れ故　→　それゆえ
但し　→　ただし
処が、処で　→　ところが、ところで
又　→　また（副詞の「又」は漢字で書く。）
〔漢字を使って書く接続詞〕
及び
又は
並びに
若しくは

問題はここです。接続詞は基本的にかな表記であるのに、この４つの接続詞だけは漢字表記が推奨されています。学振の注意書きも基本的に漢字の接続詞を用いています。

しかし、「読み手への配慮や社会の慣用に基づいて、仮名を使う場合」として、
及び　→　および（動詞の「及ぶ」は漢字で書く。）
又は　→　また（「また」がひらがなである以上、「又は」だけ漢字は変）
並びに　→　ならびに（動詞の「並ぶ」は漢字で書く。）
若しくは　→　もしくは
が可能と明記されましたので、科研費.comではこれを採用しています。
連体詞

汎ゆる　→　あらゆる
有る日のこと　→　ある日のこと
如何なる　→　いかなる
所謂　→　いわゆる
此の　→　この
其の　→　その

〔漢字を使って書く連体詞〕
来る（きたる）
去る
当の
我が
接頭辞・接尾辞

お…（お菓子、お願い）
（「おん（御）」「ご（御）」は漢字で書く（「御中」「御礼」「御挨拶」「御意見」
等）。
…げ（「惜しげもなく」等）
…とも（「二人とも」等）
…たち（「私たち」等）
…ら（「僕ら」等）
…ぶる（「もったいぶる」等）
…ぶり（「説明ぶり」等）
…み（「有り難み」等）
動詞、副詞、形容詞は漢字で書くことを基本とするが一部のものは仮名で書く
動詞のうち仮名で書くもの

居る→いる
出来る→できる（「利用ができる」 。ただし、「出来が良い」などは漢字で書く。）
成る→なる（「１万円になる」。 ただし、「歩が金に成る」「本表と付表から成る」などは漢字で
書く。）
副詞のうち仮名で書くもの

色々　→　いろいろ
概ね　→　おおむね
自ずから　→　おのずから
如何に　→　いかに
何れ　→　いずれ

可成、可也　→　かなり
此処に　→　ここに
沢山　→　たくさん
丁度　→　ちょうど
迚も　→　とても

軈て　→　やがて
余程　→　よほど
態と　→　わざと
態々　→　わざわざ
ある（動詞）・ない（形容詞）

有る・在る　→　ある
無い　→　ない

「問題がある」「欠点がない」などは仮名で書く。「有無」の対照、「所在・存在」の意を強調するときは、「財産が有る」「有り・無し」「在り方」「在りし日」「日本はアジアの東に在る」など、漢字で書く。
読み手への配慮や社会の慣用に基づいて、仮名を使う場合

接頭辞「御」（御指導→ご指導、御参加→ご参加 等）
接続詞（及び→および 又は→または 並びに→ならびに 若しくは→もしくは）
副詞（飽くまで→あくまで 余り→あまり 幾ら→いくら 既に→すでに
直ちに→ただちに 何分→なにぶん 正に→まさに 等）